Amazonプライムフォト A

Q1.仕様変更されたのでしょうか？

仕様変更ではございません。
Amazonプライムに登録された際に、5GBの無料ストレージ・無制限の写真ストレージ特典が付与されておりますが、ご利用可能なストレージを超過した時点で、写真のファイルであってもアップロードはできません。

Q2.・アップロードする際、写真とそれ以外を切り分け、写真以外のファイルがアップロード上限を越えないようにユーザー側が気をつけなければいけないのでしょうか？

上限が超えた段階で、ご確認いただいたエラーメッセージより通知させていただいております。
なお、アップロード同様、Amazon Driveのストレージはお客様の管理下となります。

現在の使用量、ストレージプランは下記URLからご確認ください。

https://www.amazon.co.jp/clouddrive/manage/

Q3.写真以外のファイルを(拡張子か何かで選別して)一覧表示する方法を教えてください

拡張子別の表示機能はございませんため、下記URLから画面右上の「Amazon Driveを検索」内に拡張子を入力のうえ検索いただくと、絞り込みが可能です。

https://www.amazon.co.jp/clouddrive/

また、拡張子ごとに一括削除はできませんため、お手数ですが、ご自身でアップロードされたファイルを確認のうえ、削除いただきますようお願いいたします。

プライムフォト・Amazon Driveに関して詳しくは下記ヘルプページをご参照ください。

http://amazon.co.jp/gp/help/customer/display.html?nodeId=201376330